金山卫指挥佥事刘本元率军驻防黄浦江，本来金山卫还能竭尽全力阻止倭寇渡过黄浦江，但是当李府阵亡的消息传来时，士气大落，防线很快崩溃。

倭寇虚晃一枪，先将抢掠来的财物搬到船上运走，然后再度回师，倾巢而来，300艘帆船一字排开，从黄浦江入海口直到上海城以南30英里的周浦。金山卫指挥使武尚文力战不支被杀，倭寇见镇海卫援兵按兵不动，遂直抵上海，喻显科见无兵可用，弃城逃跑。

上海县丞宋鳌率民壮抵抗被杀。直到唐顺之和戚继光到来，喻显科才敢现身。

说道此处，喻显科也是伤心大恸，说道：“罪员交章告急，上海百姓翘首以盼江阴之兵，镇海卫按兵不动，崇明沙所负有江防重任，且有舟师，而倭寇之来未有告警，倭寇登陆不见阻击，倭船来往于江海十数日，崇明所竟不发一兵一卒以救上海！罪员无一兵可调，无寸铁可用，上海县城墙河俱无，如何坚守？”

唐顺之看了看戚继光，显然是让他来说此事的，戚继光说道：“都宪、府尊，喻显科所说却有一定道理。但是镇海卫应该是无兵可用，苏州的镇海卫是旧称，原设在太仓的镇海卫于弘治十年撤销，改设太仓卫，但是太仓卫并非实土卫所，兵员本就不足，恐怕力有不逮。”

但是戚继光对于崇明的不救援显然起了疑心，崇明是明军重点驻防的要害，因为崇明外控夷岛，内蔽苏松，地处要塞，明军设置了两个守御千户所驻防此地，还专门设置了崇明县，准许崇明县招募乡兵，抵御倭寇，萧显带领倭寇长时间在上海附近游荡，崇明千户所会毫无察觉吗？

而且倭寇大举进攻上海，崇明驻军完全可以乘机袭击倭寇船只，要知道崇明可是有水师的。但是这次崇明置身事外，彷佛全然不知此事，没有鬼才怪了。

听了戚继光的话，唐顺之说道：“虽然事有蹊跷，但是你喻显科弃城逃跑，罪不可赦，至于怎么处理你，那是由陛下决断了。”

喻显科颓然的说道：“罪员已知必死，但是此事蹊跷，罪员不得不将此事报知府尊、都宪，否则下官纵死不得安生也！”

唐顺之命令先将喻显科看押起来，奏报朝廷后再说。